一般情况下，羊圈无需刻意消毒，定期做好清洁卫生即可。如果住地或附近发生动物传染病，可视情采取必要的消毒措施。消毒一般应每天消毒1~2次，至疫情消失为止。
羊舍没有羊床的情况下一天必须打扫一次，用羊床有刮粪机的话一天也要清理一次，没有刮粪机10~15天清理一次。每隔三五天便给羊舍进行一次消毒，一定要先清扫干净后再消毒，这样才能有好的消毒效果。
