主要引起苗枯、穗腐、茎基腐、秆腐和穗腐，从幼苗到抽穗都可受害。其中影响最严重是穗腐。苗腐是由种子带菌或土壤中病残体侵染所致。先是芽变褐，然后根冠随之腐烂，轻者病苗黄瘦，重者死亡，枯死苗湿度大时产生粉红色霉状物。
小麦赤霉病危害很大，会引起苗枯、穗腐、茎基腐、秆腐和穗腐等症状，主要由种子带菌引起，种芽会变成褐色，然后腐烂，出苗后麦苗黄瘦，容易死亡。
