黄瓜菌核病的防治方法主要有茬口轮作、及时进行清洁田园以及加强栽培管理。发病初用甲基托布津或多菌灵防治。
病菌苞子靠气流和雨水传播，发病温度16一24度、温度85%以I。以预防为主，选用抗病品种、加强肥水管理。
清选种子，剔除种子种夹杂的菌核，以减少初侵染源，提高种子质量菌核病发病严重的区域，应深翻畦土，将菌核埋入土层深处感病的品种要与抗病品种轮作。在黄瓜生长中后期感病后，及时摘除病。
