高温干旱，授粉不良，营养物质不足。
干旱，病虫害，开花期遇雨授粉不良。
缺少微量元素，种植密度过大，病虫害的危害。
生育期间的旱、涝灾害是造成高秕率的关键因素。品种的差异。以中晚熟品种发生较重，早中熟品种发生较轻。
土壤缺硼和钼是形成高空秕率的另一主要原因。硼和钼是大豆发育必需的微量元素，与荚果形成关系密切。
