玉米丝黑穗主要危害雄穗和雌穗。
该病主要为害玉米的雄穗和果穗。病株果穗短粗，基部粗顶端尖，近似球形，不吐花丝，苞叶正常，整个果穗变成一个大的黑粉包。初期苞叶一般不破裂，黑粉也不外露，后期有些苞叶破裂，散出黑粉。
