西葫芦主要的病害有病毒病、霜霉病、灰霉病、白粉病、菌核病等。病毒病的防治主要是避开高温干旱天气种植和防治蚜虫。霜霉病可用瑞毒霉500-800倍液喷施。
灰霉病可用800倍的代森锌或多菌灵防治。白粉病可喷施1500倍粉锈宁或500倍的托布津。菌核病可用40％菌核净1000倍液或多菌灵500倍液喷施。蚜虫是主要的虫害，可用2000倍速灭杀丁防治。
