传播途径主要通过蚊虫(库蚊、伊蚊、按蚊等)叮咬传播，其中最主要的是三带喙库蚊。越冬蚊虫可以隔年传播病毒，病毒还可能经蚊虫卵传递至下一代。病毒的传播循环是在越冬动物及易感动物间通过蚊虫叮咬反复进行的。猪还可经胎盘垂直传播给胎儿。
乙脑主要通过蚊的叮咬而传染。能传播乙脑的蚊有库蚊、伊蚊和按蚊。蚊感染乙脑病毒，可终生带毒，病毒在蚊体内增殖并随蚊越冬，成为次年感染猪的传染源。该病毒感染妊娠母猪可通过胎盘屏障侵害胎儿,为垂直感染。
